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- 民國34年，訂嘉義市為省轄市，設嘉義市稅務稽徵所，民國36年改稱稅捐稽徵處。
- 民國39年10月，全台行政區域調整，嘉義市改制為嘉義縣，本市改為嘉義縣轄市，本處亦併入嘉義縣稅捐稽徵處。
- 民國71年7月1日嘉義市改制升格為省轄市，並設市稅捐稽徵處但仍與嘉義縣稅捐稽徵處合署辦公。
- 民國88年6月30日與嘉義縣稅捐稽徵處正式分署辦公，編制員額為135人。
- 配合營業稅92年1月1日移撥國稅局，本處辦理組織修編，修編後員額為115人。
- 為配合地方制度法及嘉義市政府組織自治條例修正，自97年1月31日起更名為「嘉義市政府稅務局」。
- 民國107年1月1日，為使嘉義市政府財源規劃管理一元化，靈活運用人力資源，將財政處與本局整併成立「嘉義市政府財政稅務局」，修編後員額為119人。
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